基本的な操作方法がわかりません。

Yで攻撃(キャラクターによって攻撃は異なる)、Xでキャラクター交代、Aでレゴの組み立てor固有スキルの発動、Bでジャンプです。
詳しくはこちら。

2人プレーはできますか？

できます。

セーブはどうやってしますか？

ジュラシックワールドのマークとSDカードマークのついている墓石のようなものでセーブできます。
オートセーブ機能もありますが、セーブをしないでゲームを終了すると同じストーリーを繰り返してしまうこともあるので、随時セーブすることをオススメします。